Ha conseguido el certificado AENOR de Sistema de Gestión Ambiental basado en la Norma ISO 14001 que cubre las operaciones aéreas y el apoyo a las mismas, el mantenimiento de aeronaves, vehículos, sistemas de telecomunicaciones e infraestructuras, así como las actividades deportivas. La Base Aérea de Villanubla (Valladolid) cumple así con los requisitos que establece la ISO 14001, contribuyendo a prevenir los impactos ambientales, utilizando los medios necesarios para evitarlos, reducirlos o controlarlos, pero siempre en equilibrio con la racionalidad socioeconómica y apostando por una mejora continua.